房产证原件留在银行是银行的一种担保行为，银行必须要保证你在没有能力偿还贷款的时候可以收回自己的贷款，从而要求贷款人提供的一种担保。虽然你把房产证抵押给了银行，但是你依旧可以卖房。银行通过限制你对房子的处分权，来保障银行自己的抵押权能够在将来顺利实现。
当然，这个房子的所有权还是你的，你是法律意义上的所有权人，因为房产证上的名字是你的，不是银行，你大可以不必担心。
同时，这也不影响你办理户口迁移，你只需要到当地的房地产管理局开个证明或者要求银行出具证明就可以了，没有什么影响。
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